Accendete il forno a 180°C. Mettete in una ciotola la farina integrale con il bicarbonato, il sale, lo zucchero e (se la usate) la cannella; mescolate bene con una frusta.

Versate in una brocca il latte vegetale, l'estratto di vaniglia, l'olio e il succo di limone e mescolate brevemente. Versate il tutto nella ciotola con gli ingredienti secchi, unite anche le fave di cacao e mescolate l'impasto solo il tempo necessario a renderlo omogeneo.

Versate l'impasto dei muffin negli stampini, riempiendoli fino a 3/4 ciascuno. Infornate subito e lasciate cuocere per 25 minuti, sfornate e lasciate intiepidire prima di sformare i muffin e servirli.